Annoncée en juillet 2005 par le président de la République Jacques Chirac et le Premier ministre israélien Ariel Sharon, lors de la visite de ce dernier à Paris, la Fondation France-Israël est présidée par Jacques Huntzinger, l’ancien ambassadeur de France en Israël.
Haïm Musicant, Joseph Roubache et Gérard Unger font partie du conseil d’administration de l’association de préfiguration de la Fondation France-Israël.