Le président du Crif a vivement réagi suite aux propos d’Olivier Faure appelant à hisser le drapeau palestinien sur le fronton des mairies le 22 septembre, jour où le président de la République a annoncé reconnaître l’État palestinien aux Nations Unies. Yonathan Arfi a dénoncé une « surenchère démagogique et clientéliste ». « Cet appel à hisser le drapeau palestinien dans les mairies alors que c’est illégal […] me paraît être quelque chose de grave. […] J’appelle à la responsabilité des élus et des maires qui auraient été sensibles à cet appel, pour leur dire que c’est introduire dans leur commune un débat qui divise les Français, c’est importer en France un conflit étranger. C’est profondément contraire à l’esprit de la République. Les mairies ont un devoir de neutralité et je compte sur les élus pour respecter cet impératif de neutralité. »

Les 8 et 9 septembre 2025, le Crif participait au 10e Forum des Directeurs du World Jewish Congress, à Bratislava. Ce forum des Directeurs a réuni les dirigeants des organisations juives d'une cinquantaine de pays, l'occasion de réfléchir aux problématiques communes et d'échanger sur les bonnes pratiques de chaque communauté.

Jeudi 11 septembre 2025 était rendu public le rapport de la commission d’enquête de l’Assemblée nationale sur les effets psychologiques de TikTok sur les mineurs. Auditionné au cours de l’été, le Crif a eu l’occasion de contribuer à ses travaux.

La commission culture du B'nai B'rith France, présidée par Claire Rubinstein, a réalisé un nouvel ouvrage intitulé « Juifs de France du Moyen-Age à la Renaissance : de l’errance à l’enracinement ».

Dans un communiqué en date du 10 septembre 2025, le Musée d’art et d’histoire du Judaïsme (MahJ) a indiqué que « pour la première depuis sa création en 1998, le musée […] voit un des colloques scientifiques qu’il coorganise boycotté par des chercheurs ». Ce boycott s’inscrit dans une série plus large de discriminations et d’exclusions qui touche ces derniers jours notamment le monde de la recherche et de la culture. Le président du Crif a réagi sur X (ex-Twitter) : « Va-t-on laisser un climat de boycott, d'intimidation et de terreur intellectuelle s'installer au nom prétendument de la cause palestinienne ? [...] Jusqu’à quand laissera-t-on s’installer cette atmosphère haineuse et inquisitrice ? Ce maccarthysme antisioniste est un danger pour les Français juifs mais aussi pour le pluralisme de notre débat public. »